Все оплаты будут ожидаться в соответствии со сроком CoS. Как только рассматривающий заявление визовый офицер увидит, что IHS неоплачен, либо недоплачен, он выставит вам счет на оплату, и будет ждать, пока необходимые средства не поступят. Если не дождется, вынесет решение об отказе в визе.
Вы что-то явно не так понимаете. Permanent - это работник, постоянно работающий на одного работодателя и получающий зарплату напрямую от этого работодателя. Договор же такого работника может не иметь окончательной даты трудоустройства, может быть заключен на год, два с условием автоматического продления при отсутствии каких-то препятствий для такого продления и так далее и тому подобное. Также никто не мешает работнику и работодателю при соблюдении определенных условий расторгнуть "permanent position" договор.
Договор и CoS связаны весьма опосредованно. Home Office не занимается проверкой или установлением правил заключения трудовых договоров. Home Office рассматривает заявку на выдачу сертификата спонсорства и либо одобряет, либо отклоняет её. Затем Home Office рассматривает заявление на визу, связанное с этим сертификатом по условиям этого сертификата.